La cantidad de dongles que puedes usar en una máquina depende directamente del número de puertos USB disponibles.
En entornos donde se utilizan varios programas de software, cada uno puede requerir una llave de licencia distinta.
Si varias personas comparten la misma llave de seguridad, aumenta el riesgo de perder o dañar el dongle físico, cuyo reemplazo puede resultar costoso.
En entornos virtuales o escritorios remotos, muchos sistemas operativos invitados no pueden reconocer de forma nativa un dongle conectado al equipo host.