Le nombre de dongles USB utilisables sur un ordinateur peut être limité par la quantité de ports physiques disponibles.
Lorsque plusieurs logiciels sont utilisés avec chacun une clé distincte, la gestion physique devient contraignante.
Partager un seul dongle entre plusieurs personnes peut entraîner sa perte ou son endommagement. Or, remplacer ces dispositifs peut s’avérer coûteux.
Dans un environnement virtuel ou sur un poste distant, il est souvent impossible de connecter directement un dongle physique depuis le système hôte.