Un ordinateur ne peut accueillir qu’un nombre restreint de dongles en fonction de ses ports USB disponibles.
Si plusieurs logiciels sont utilisés, chacun avec sa propre clé de licence, cela peut devenir contraignant.
Partager la même clé de sécurité entre plusieurs personnes augmente le risque de perte ou de détérioration du dongle, dont le remplacement peut être coûteux.
Dans un environnement virtuel ou en bureau à distance, de nombreux systèmes invités ne peuvent pas se connecter directement à un dongle branché sur l’hôte.