Le nombre de dongles USB utilisables dépend du nombre de ports disponibles sur une machine.
Lorsque plusieurs logiciels sont utilisés, chacun peut nécessiter une clé de licence distincte.
Si plusieurs personnes utilisent la même clé de sécurité, cela augmente le risque de perte ou de détérioration du dongle physique, coûteux à remplacer.
Travailler dans un environnement virtuel ou via un bureau à distance peut poser problème, car de nombreux systèmes invités n’ont pas la capacité native de se connecter à un dongle branché sur la machine hôte.