Il numero di dongle utilizzabili su un PC dipende dal numero di porte USB disponibili.
Quando si utilizzano più software, ognuno può richiedere una chiave di licenza diversa.
Se più persone condividono la stessa chiave di sicurezza, aumenta il rischio di perdita o danneggiamento del dongle fisico, spesso costoso da sostituire.
In ambienti virtuali o desktop remoti, molti sistemi operativi guest non hanno la capacità nativa di collegarsi a un dongle USB connesso alla macchina host.