使用可能なUSBポートの数に制限があるPCでは、同時に複数のドングルを接続できない場合があります。
複数のソフトウェアを使用していて、それぞれが異なるドングルを必要とする場合の管理は煩雑です。
1つのドングルを複数人で使い回すと、紛失や物理的損傷のリスクが高まり、再発行のコストもかさみます。
仮想マシンやリモートデスクトップ環境では、ホスト側に接続されたドングルをゲストOSが認識できない場合が多く、業務に支障をきたします。