1台のPCで利用できるドングルの数は、USBポート数に依存します。
複数のソフトを同時利用する場合、それぞれ異なるドングルキーが必要となり管理が煩雑になります。
複数ユーザーが同じセキュリティキーを使うと、紛失や破損のリスクが高まり、代替品のコストもかさみます。
多くのゲストOSは、ホストに直接接続されたドングルを認識できないため、仮想環境やリモートデスクトップでは利用が困難です。