هناك حد لعدد مفاتيح الدونجل التي يمكن لجهاز الكمبيوتر استخدامها، ويعتمد ذلك على عدد منافذ USB المتاحة.
عند استخدام عدة برامج، ولكل منها مفتاح ترخيص مختلف، قد يصبح التبديل بين الدونجلات أمرًا مرهقًا.
استخدام نفس مفتاح الأمان من قبل عدة أشخاص قد يؤدي إلى فقدانه أو تلفه، واستبداله قد يكون مكلفًا.
العمل في بيئة افتراضية أو على سطح مكتب بعيد قد يمثل تحديًا، حيث أن العديد من أنظمة التشغيل الضيف لا تدعم الاتصال المباشر بمفتاح دونجل موصول بالجهاز المضيف.