Počet USB dongle je omezen dostupnými porty na počítači.
Při provozu různých licenciovaných aplikací je správa více klíčů složitá.
Sdílení stejného dongle klíče mezi uživateli zvyšuje riziko poškození nebo ztráty – náklady na náhradu mohou být vysoké.
Mnoho hostitelských OS neumí pracovat s fyzickými dongle v rámci virtuálních nebo vzdálených prostředí – Donglify toto omezení překonává.